Výbor nenahrazuje ani nemění zákonem stanovené odpovědnosti jednotlivých resortů, ale usiluje o účinnější spolupráci mezi nimi. Realizace většiny politik má vliv na území. Všechny politiky státu a krajů by měly přispívat k harmonickému rozvoji území a neměly by být příčinou vzniku meziregionálních rozdílů nebo ty již existující dále prohlubovat. Ambicí Výboru na vládní úrovni je vybudovat mechanismus, který by zajistil efektivní koordinaci politik, jejich zasazení do vzájemného kontextu a průběžné vyhodnocování jejich dopadů na rozvoj regionů. Činnost Výboru směřuje k zajištění efektivního využívání veřejných prostředků, posílení regionální soudržnosti a k podpoře vyváženého rozvoje všech regionů České republiky.