Dne 11. 8. 2024 bylo vydáno upřesňující metodické stanovisko k Pravidlům pro žadatele a příjemce, které se týká veřejných zakázek. Toto stanovisko je určeno pro všechny výzvy vyhlášené MMR v rámci Národního plánu obnovy. Řídit se tímto stanoviskem je povinné pro všechny žadatele, u jejichž projektu v MS 2014+ nebylo dosaženo stavu PP42 - projekt finančně ukončen ze strany MF-PCO.
Ke dni 3. 4. 2025 bylo upřesňující metodické stanovisko aktualizováno z důvodu navýšení limitů pro veřejné zakázky. Aktualizace stanoviska se týká navýšení z 2 mil. Kč na 3 mil. Kč u dodávek a služeb a z 6 mil. Kč na 9 mil. Kč u stavebních prací.